بدأت مرحلة تأسيس الخدمات الطبية خلال الفترة 1941-1962 حيث ضمّت في عام 1941 طبيبا واحدا وآلية واحدة وتم تعيين أول مدير للخدمات الطبية في عام 1948 وهو الطبيب سليمان النجار، وكانت تمثل وحدة صحية بسيطة واقتصر دورها خلال تلك الفترة على تقديم الرعاية الطبية والوقاية الصحية لمنتسبي القوات المسلحة فقط.