مع ظهور الإسلام وبداية الفتوحات الإسلامية في القرن السابع سقطت ثلاثة مراكز مسيحية شرقية وهي الإسكندرية ، أنطاكية و القدس على ايدي المسلمين وتحول مركز العالم المسيحي بين القسطنطينية و روما ، تحول المسيحيين إلى رعايا تحت الحكم الإسلامي و أهل الذمة كأهل ذمة ، ومع أدى انتصار العباسيين وتحول مركز الخلافة إلى بغداد إلى تقارب بين الخلفاء وبطاركة كنيسة المشرق.